多年来，许多研究发表证明了超声波清洗在医疗行业使用的可靠性和有效性。研究证明了使用超声波清洗明显比手工清洗更有效和高效。手工清洗难以标准化，而且效果因人而异与手工擦洗相比，超声波清洗机是自动化和标准化的，且清洁效果可以延伸至人工无法触及的表面。
人工清洗的目的是清除仪器表面的粗碎屑，超声波清洗机的目的是清除微生物和其他较难接触的表面的细碎屑。一些报告表明，先用超声波清洗，再用手擦洗，比单独使用任何一种方法更能减少污染物。虽然有数据显示其在一些复杂器械的狭窄管腔和通道的有效性是有限的，但还是建议使用超声波清洁器来提高清洁效率，特别是对于手术器械，如活检钳，有复杂的节点、铰链和其他内部表面。
尽管超声波清洗有许多优点，但就像任何去污过程一样，它也有其局限性，我们需要完全地理解它的安全利用和有效应用。例如，由于超声波的强力擦洗作用，并不是所有的医疗器械都需要超声波能量。尽管大多数手术器械，在使用说明中建议将超声波清洗作为最终灭菌的一个完整步骤，但一些器械可能由被其功率损坏的精细材料构成，排除了超声波能量的使用。如石英、硅和碳钢等材料，在长时间暴露于超声空化后，可能会腐蚀或被腐蚀。如果不能消除超声波能量引起的腐蚀，则可以通过减少超声波清洁器的功率和清洗时间来最小化。故这时建议检查每台仪器的使用说明书，以确定制造商是否禁止超声波清洗。
另外，超声波清洗通常是一个多步骤的过程，从人工清洗开始，以清除粗碎屑。这个步骤应在仪器使用后立即执行。一旦手动清洗，仪器就会被放置在超声波清洗机中。这个清洗步骤对于清除手工清洗过程中可能没有清除的细小碎片特别重要。有些超声波清洗机会自动将清洗剂注入仪器的加工池中，并在终端灭菌前润滑仪器以防止腐蚀。有些还可能配备通道适配器，可通过空心器械的内腔进行清洁剂溶液冲洗。
通常超声波清洗机都有定时器和温度控制，分别调节清洗时间和提高洗涤液的温度。制造厂商一般都会配备可以调节其功率输出(W)和频率(kHz)的控制装置。在清洗过程中尽量要减少人员接触带来的潜在有害污染物和气溶胶的覆盖物，包括仪器托盘、支架和篮子等。
总的来说，超声波清洗在医疗行业起着至关重要的作用以及必要性，它给整个医疗行业带来安全性和有效性。
